可根据需要进行需氧菌培养、厌氧菌培养、结核杆菌培养、或真菌培养，用于呼吸道感染的病因诊断。痰培养的理论依据是致病菌应高于污染菌，据此，对痰液进行定量培养和办定量培养。常与药物敏感试验一起进行。
1.由于咳痰标本常受到口咽部定居细菌的污染，分离得到的细菌往往不能真正代表下呼吸道感染的病原菌，应密切结合临床进行分析，必要时进行多次培养。
2.痰液的细胞学筛选：将痰液直接涂片后光学显微镜检查，每低倍视野鳞状上皮细胞小于10个，白细胞大于25个，或鳞状上皮细胞：白细胞< 1：2.5，可认为痰液来源于下呼吸道，即为合格痰标本。
3.由于痰的非均质性，定量培养之前需先将标本液化和匀化。
4.采样前使用过抗菌药物者，检测到的感染菌浓度降低，可导致假阴性结果。
阴性：
正常：阴性，即无致病菌生长。
阳性：
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