代谢性酸中毒的病因鉴别诊断中值得特别提出的是肾小管性酸中毒，主要是进行I型和II型肾小管酸中毒的鉴别诊断。
其次重点与呼吸性酸中毒相鉴别，吸性酸中毒除了需要鉴别急性和慢性以及在慢性呼吸性酸中毒基础上合并急性呼吸性酸中毒以外，还需要和并代谢性酸碱中毒的混合性酸碱平衡紊乱相鉴别。
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