西医治疗
(1)急性痢疾普通型的治疗
①常规疗法:患儿要卧床休息、隔离和采用消毒措施。饮食以流食或半流食为主，吐泻、腹胀重的患儿可短期禁食。
②抗生素疗法：可选用氟哌酸、庆大霉素、黄连素和复方新诺明等联合口服。疗程7-10天。
③吸附疗法:可给予思密达，其对细菌和毒素有强大的吸附作用，并可抑制细菌生长，还可与黏液蛋白结合并相互作用，加强肠道黏膜屏障作用。
④微生态疗法：可用含双歧杆菌制剂。它通过与肠道黏膜上皮细胞结合，起占位性保护作用，抑制细菌入侵，维持肠道微生态平衡。
⑤补液疗法:根据脱水情况决定补液方法和补液量。
(2)慢性痢疾的治疗
西医治疗
①抗生素疗法常用药物和剂量同急性菌痢的治疗，但疗程要长。可采用间歇疗法，用药7-10天，休息4天，再治疗4天，休息4天，再重复4天，总疗程3-4周。也可用黄连素或大蒜混合液灌肠治疗。但应注意长期使用抗生素可引起肠道菌群失调。应在大便培养转阴、脓血便消失后即改用中药、维生素、微生态制剂和思密达等药物。
②饮食疗法：慢性菌痢除抗菌治疗外，还应注意改善患者的营养状态。
(3)中毒型痢疾的治疗
①改善微循环:可利用阿托品类药物解除血管痉挛，防止休克。用多巴胺、酚妥拉明、异丙肾等扩张血管。用冬眠药物氯丙嗪抑制血管壁上受体，使微血管扩张，改善微循环，且有镇静、降低基础代谢作用。用糖皮质激素、氢化可的松消炎、减轻脑水肿、减轻中毒症状。
②扩容及纠酸：按输液速度先快后慢、先盐后糖、见尿补钾的补液原则进行。
③呼吸衰竭:吸氧，保持呼吸道通畅，使用呼吸兴奋剂，危重者给予气管插管或人工呼吸。
④减轻脑水肿：对脑型病例应及时使用脱水剂甘露醇，加地塞米松静脉推注或快速静脉滴注。
⑤控制感染:及时作药敏试验，合理使用抗生素。在药敏结果出来以前，一般首选喹诺酮类药物如环丙氟哌酸静脉给药，但因此类药可能会影响幼童骨骼发育，疗程不宜过长。一般为5-7天。还常用头孢菌素，如头孢哌酮、头孢氨噻肟控制感染。
⑥降温：可用莱比林、扑热息痛、萘普生等降温，也可冷盐水灌肠、物理降温。
⑦痢特灵即呋喃唑酮。该药对痢疾杆菌、沙门菌等均有抗菌作用，且不易产生耐药性，与其他细菌间也无交叉耐药性，口服后在肠道内浓度高。常用剂量成人每次为0.1~0.2克，每日口服3次。由于痢特灵的副作用较大，还容易引起药物不良反应，因此现在较少应用。
⑧黄连素该药口服后吸收差，对痢疾杆菌作用强，故常用于菌痢的治疗。剂量为每次服用0.3克，每日3-4次。
⑨磺胺类该类药物口服较难吸收，故可用于抗肠道感染。目前临床上较常用的是复方磺胺甲基异嗯唑，剂量为每次2片，每日服2次。[2]
中医治疗
1.湿痢疾
治法清热燥湿，调气行血
方药
芍药汤加减方中黄芩、黄连清热燥湿，解毒止痢;大黄、槟榔荡热去滞，通因通用;木香、槟榔调气行滞;当归、芍药、甘草行血和营，缓急止痛;肉桂辛温，反佐芩、连。大黄之苦寒，共成辛开苦降之势，以散邪气之结滞。痢疾初起，去肉桂，加银花、穿心莲等加强清热解毒之力。有表证者，加荆芥、防风解表散邪，或用荆防败毒散，逆流挽舟。兼食滞者，加莱菔子、山楂、神曲消食导滞。痢下赤多白少，肛门灼热，口渴喜冷饮，证属热重于湿者，加白头翁、黄柏、秦皮直清里热。痢下白多赤少，舌苔白腻，证属湿重于热者，去黄芩、当归，加茯苓、苍术、厚朴、陈皮等运脾燥湿。痢下鲜红者，加地榆、丹皮、仙鹤草、侧柏叶等凉血止血。
2.寒湿痢
治法温化寒湿，调气行血
方药 胃苓汤加减
3.疫毒痢
治法清热解毒，凉血止痢
方药 白头翁汤加减
4.虚寒痢
治法温补脾肾，涩肠固脱
方药真人养脏汤加减
5、阴虚痢
治法 养阴泄热，清肠止痢
方药驻车丸合黄连阿胶汤加减
6.休息痢
治法 益气健脾，调气导滞
方药参苓白术散加减
食疗
●黄芩、黄柏、炒地榆、炒仙鹤草各15克，炒山楂、炒麦芽各30克，车前草10克，白术30克。水煎服，日一剂，分两次服完。主治菌痢。
●炒白术、炒山药各30克，赤石脂20克，罂粟壳10克，车前子(包煎)15克。水煎服，日1剂，分2次服。主治菌痢。
●石榴皮、地榆各50克。水煎服，日1剂，分3次服。主治菌痢。
●猪苦胆一个，绿豆适量。将绿豆装入苦胆内，待胆汁浸入绿豆后倒出，阴于口服，每日两次，每次10粒。主治菌痢。
●生姜9克、鸡蛋1枚。生姜捣碎打入鸡蛋相和蒸熟，空腹顿服，日 2次。主治痢疾初起而兼有恶寒发热表证者。
常用草药
鸦胆子为苦木科常绿灌木或小乔木鸦胆子的成熟种子，主产于广西、广东等省。秋季果实成熟时采收，晒干，去壳取仁，以干龙眼肉及胶囊包裹吞服，或压去油，制成丸剂或片剂服。本品性味苦寒，归大肠、肝经。有清热解毒、治痢截疟、腐蚀赘疣的功效。口服可用来治疗热毒血痢、冷积久痢及各型痢疾，外用可治鸡眼赘疣。根据前人治疗冷积久痢的经验，近代临床将之用于治疗阿米巴痢疾，采取口服与灌肠并用的方法。口服，成人每次10～20粒，小儿每岁1～2粒，装胶囊吞服，每日3次，7～10天为1疗程，并用20粒鸦胆子研碎，加入1%小苏打液200ml，浸泡2小时，作保留灌肠，每日1次，对急慢性阿米巴痢疾有较好的效果。其作用机理主要是鸦胆子及其有效成分对阿米巴原虫有杀灭和抑制作用。本品对胃肠道及肝肾均有损害，不宜多用久服。胃肠出血及肝肾病患者，应忌用或慎用。
白头翁为毛茛科多年生草本植物白头翁的根。分布于中国东北、内蒙古及华北等地。春季开花前或秋末叶黄时方可采收，除去叶及残留的花茎和须根，保留根头白绒毛，洗净泥土，晒干，生用。本药性味苦寒，归大肠经，有清热解毒、凉血止痢的功效，临床常用来治疗热毒血痢，与秦皮配伍煎汤外洗，可用治阴痒，即滴虫性阴道炎。用本品治疗细菌性痢疾和阿米巴痢疾，均有良好的效果。如治阿米巴痢疾，可单用白头翁15～30g，水煎，分3次服，7天为1疗程;病重者另用本品30～60g，煎水保留灌肠，每日1次，疗效颇佳。白头翁治疗阿米巴痢疾的主要机理是：白头翁煎剂及所含皂甙有明显的抗阿米巴原虫作用。