男性不育的主要原因是精子数量少、精子畸形率高或活动度差以及射精功能障碍或精液输出管道阻塞。
很多先天性疾病和外伤等后天性包括慢性健康问题、不良生活方式和其他的多种因素包括生活环境、食物、药物、生活习惯均是导致男性不育的重要原因。通过对男性患者、其配偶或者双方同时治疗，相当一部分男性不育症是可以得到治疗。
疾病因素
1、 影响精子生成和精液质量的因素；
a) 精索静脉曲张
b) 感染
c) 精子抗体
d) 肿瘤
e) 隐睾
f) 内分泌紊乱
g) 染色体异常
h) 腹腔或盆腔疾病
i) 某些药物
2、 影响精液射出的因素
a) 输精管道病变
b) 腹腔或盆腔疾病
c) 某些药物
d) 性欲减退
e) 勃起功能障碍
f) 射精功能障碍
环境因素
1、 杀虫剂
2、 暴露于重金属环境
3、 X射线或放射线
4、 睾丸温度过高
5、 长时间骑自行车
生活方式
1、 吸毒
2、 酗酒
3、 吸烟
4、 精神紧张
5、 维生素缺乏
6、 肥胖
7、 老龄