本症可发生于任何年龄，但2/3 病例发生在30～50 岁，男性多于女性。起病缓慢或亚急性，如新型隐球菌与曲霉菌脑内感染都原发于上呼吸道(鼻腔)黏膜和肺，经血行播散。大多数原发病变症状尚不明显时，即出现神经系统症状。病人一般有低热，偶有高热，首发症状多为头痛，伴恶心、呕吐，有颈项强直等脑膜刺激症。病程数周至半年，偶有超过1 年者，少数病例可有缓解和复发。和脑脊液检查与结核性脑膜炎相似，故应反复做脑脊液检查和涂片，如查到真菌有助于鉴别诊断。