有关本病的病因，目前尚不清楚。多数人认为，缺铁是本病最基本的因素。这是因为铁的不足引起上皮层的改变，导致吞咽困难。例如患缺铁性贫血病人往往同时有上食管蹼。缺铁是本征的最基本的原因，好发于偏食者，但因缺铁性贫血患者并不都有吞咽困难，故缺铁并非唯一的原因，可能还与B族维生素缺乏、体质、种族及家族等因素有关。至于妇女发病率高的原因可能是由于吞咽困难减少了含铁饮食的摄入，加上妇女月经期铁的丢失所致。婴儿偶发该病，很可能是先天性的原因，也可能与缺铁贫血有关。