1.胃溃疡 上腹痛多在餐后0.5～1h出现，经1～2h逐渐自行缓解，但发作有周期性，易发生在初春及秋末季，服用抗酸药及黏膜保护剂疼痛可缓解，胃镜检查可确定。

2.慢性胰腺炎 有进食后腹痛、体重减轻、腹泻、消化不良等症状，与本病相似。根据腹部B型超声检查、CT、MRCP、ERCP及腹部平片检查可鉴别。

膈下弓状韧带压迫综合征：多见于青年女性，男女之比1∶3。表现为与饮食无关的间歇性上腹钝痛，伴恶心、呕吐或腹泻。体重减轻，消瘦和营养不良。体格检查可在腹部闻及较响亮的收缩期吹风样杂音。发病机制大多因膈下弓状韧带或腹腔神经节压迫腹腔动脉的起始部而导致缺血。血管造影可证实受压或狭窄、远端扩张，而无动脉粥样硬化的表现。

还应与胃肠道肿瘤、克罗恩病、局限性肠炎、假膜性肠炎、出血性肠炎、胰腺癌、胆道疾患、肾绞痛等鉴别。克罗恩病有些类型可能就是缺血性肠病的慢性型，特别是可找见增生闭塞性血管病变者。