(1)对性功能和生育的影响：主要表现为性功能减退，如同房时间短或早泄，可能与肉芽肿性前列腺受到炎性刺激有关。阳萎与肉芽肿性前列腺炎的关系尚不肯定，肉芽肿性前列腺炎并不直接损害阴茎勃起的神经-血管功能。长期的不适感在患者心理上产生压力，使他们产生抑制和担心，特别是对不了解本病的患者常会认为自己的性功能有问题。久而久之可能产生精神性阳萎。前列腺炎并发精囊炎时可以出现血精。

精液的主要成分是前列腺液，而且自睾丸、附睾排出的精子必须经精浆包括前列腺液的营养、输送，才具有与卵子结合的能力。肉芽肿性前列腺炎的患者其精液常规往往表现为精子的活力较低，死亡率偏高。前列腺炎患者的不育症的发生率明显高于正常人群。

(2)对全身的影响：肉芽肿性前列腺炎除表现为局部泌尿系统的症状外，亦可表现为变态反应性虹膜炎、关节炎、心内膜炎、肌炎等。

肉芽肿性前列腺炎的患者往往表现出明显的精神症状，患者情绪紧张、精神压力大，长此以往可以导致全身乏力、失眠、多梦、容易疲劳、疑病和焦虑。这些患者常常过分地注意自己的健康状况。并多方面地寻找证据来证实，不管医师们怎样耐心解释也很难改变他们的疑病心理。虽然患者对医师的解释与治疗常常持怀疑态度，但求治心理又相当迫切。前列腺炎与精神症状的关系尚不明确，精神紧张为什么会导致前列腺炎，前列腺炎怎么又产生精神神经症状，值得进一步研究。精神神经症状与个体的人格特征有直接的内在联系，所以不同的肉芽肿性前列腺炎的个体表现出精神症状的程度可以千差万别。