单纯疱疹脑炎较非单纯疱疹脑炎的预后差，有报道前者的自然病死率为70%，采用阿糖腺苷治疗的病死率为40%。瑞典有报道，用阿昔洛韦治疗6个月内病死率仅19%。
散发性脑炎的预防关键在于早期诊断、早期治疗提倡科学养生，有劳有逸张弛有度有了感冒就要休息，不提倡过劳带病坚持等不科学的方法对待疾病。平素锻炼身体鵻，增强体质，提高自身免疫力，儿童要按规定接受预防注射。