内分泌疾病大多伴有内分泌功能紊乱，治疗内分泌疾病就是要调整内分泌功能，对于功能亢进的就要使之降低，功能低下的则要使之升高，恢复正常。
(1)对于功能亢进的可采用下面一种或几种方法进行治疗。
①手术切除内分泌肿瘤，或切除大部分增生的内分泌腺体。
②用放射线照射或内服同位素来破坏功能亢进的肿瘤或增生的腺体，如垂体瘤作放射治疗，甲亢口服同位素碘。
③用药物抑制激素的合成，如用抗甲状腺药物抑制甲状腺激素的合成。
④用激素抑制相应的促激素的分泌和制造，达到治疗功能亢进的目的，如用糖皮质激素抑制垂体产生促肾上腺皮质激素来治疗先天性肾上腺皮质增生症。
⑤用药物来对抗某一激素的生理作用，使之不能发挥原来的作用，如安体舒通能对抗醛固酮对肾脏保留钠排泄钾的作用，因而可以治疗醛固酮增多症。
(2)对于内分泌功能减退者，原则上是补充其不足，可采用以下方法。
①补充人体在正常情况下所需要的量，即补充生理剂量激素。如甲状腺功能减退症补充甲状腺激素，肾上腺皮质功能减退补充氢可的松，缺乏胰岛素的糖尿病用胰岛素治疗。