本病应与以下疾病鉴别：

1.急性链球菌感染后肾小球肾炎：发病前1～3周，有链球菌感染的前驱病史，以血尿、浮肿及高血压为三大主要症状。持续肉眼血尿时间较长，可从数天到数周，这点和IgA肾病发作性血尿不同。实验室检查有补体C3下降，ASO、血沉升高。

2.良性家族性血尿：本病多有家族史，临床90%表现为持续性镜下血尿，仅少数伴间歇性发作性血尿。一般无症状，多在体检或尿常规检查中发现。电镜证实其中一部分为薄基底膜底(基底膜厚度约为正常人数的1/3～2/3)。预后良好。

3.家族性遗传性肾炎：多为持续性镜下血尿，男重于女，呈进行性肾功能减退，50%伴有神经性高频区耳聋，15%有眼部异常，男性死亡率高。

4.左肾静脉压近综合征：属非肾性血尿，无肾小球肾炎的临床表现。

5.特发性高钙尿症：表现为持续性镜下血尿，或伴有发作性肉眼血尿，为非肾小球性血尿，尿Ca> 0.1mmol/kg (4mg/kg/d)，尿Uca/Ucr的比值若>0.21可初步诊断本病。

6. 紫癜性肾炎：常表现为镜下血尿。但患者有皮肤出血点，出现在四肢远端、 臀部及下腹部, 多对称性分布, 稍高于皮肤表面, 可有痒感, 1～2 周后逐渐消退, 常可分批出现。