发生的原因有两个：一是由于腺体导管远端堵塞，而粘膜又持续分泌，致使近端扩张形成上皮囊肿，此被称为潴留囊肿；另一种是由于腺体破损，粘液外漏进入组织间隙，形成无上皮衬里的囊肿，称为外渗性囊肿。粘液囊肿从绿豆大小到蚕豆大小均有，舌下腺囊胖甚至可以更大，囊肿至淡棕黄色，受创破裂后流出蛋清样棕黄粘液，反复破损常常会使局部硬结，表面粘膜呈白色。