临床上金葡菌肺炎须与下列疾病相鉴别：肺炎球菌、链球菌及其他革兰阴性杆菌肺炎、流感嗜血杆菌或肺炎杆菌肺炎，原发性肺结核伴空洞形成或干酪性肺炎，气管异物继发肺脓肿及横膈疝等。X线表现的特点，如肺脓肿、大疱性肺气肿及脓胸或脓气胸等存在都可作为金葡菌肺炎诊断的根据;但需与其他细菌性肺炎所引起的脓胸及脓气胸鉴别，因而病原学诊断十分重要。