丙型肝炎病毒(hepatitis virus C，HCV)是一小的有囊膜的单股正链RNA病毒，属黄病毒科丙型肝炎病毒属。HCV基因组为一长的开放读码框架(ORF)，在其两侧的5′和3′均有非编码区，从5′端开始，编码区由7个基因区组成，即C、E1、E2、NS1、NS2，NS3、NS4和NS5，C区编码核衣壳蛋白，E1区和E2/NS1区编码包膜蛋白。包膜区基因是基因组变异最大的部分，故迄今HCV感染者几乎均检测不到对HCV的中和抗体可能与此有关，也可能是引起HCV易持续感染和疾病慢性化的一个原因。NS2～NS5编码非结构蛋白，其中有的功能还不很清楚。NS3编码螺旋酶和蛋白酶，NS3蛋白抗原性强，产生的抗体具有重要诊断价值。NS5编码依赖RNA的RNA多聚酶，NS5蛋白抗体阳性似乎与病毒活动有关。HCV的实验室检测可用PCR方法检测病毒的RNA，也可检测抗体。