包括甲状腺球蛋白抗体、甲状腺微粒体抗体、TSH受体的抗体等，抗体均具有器官特异性及种属特异性(与灵长穆有交叉反应)，具有疾病典型性，但不具疾病特异性。主要属IgG抗体，很少为IgA及IgM。
(1)仅出现一个抗体的低滴度时，异无多大实际意义，因为这也可见于许多其他疾病及健康者，特别是较老龄妇女常能测到。
(2)无较高抗体滴度的弥散性甲状腺肿可凝为恶性肿瘤。
正常：
抗甲状腺微粒体抗体(抗-TM)(-)
抗甲状腺球蛋白抗体(抗-TC)(-)
抗甲状腺上皮细胞胞浆抗体(-)
长效甲状腺刺激素(LATS)或抗促甲状腺素(TSH)受体抗体(-)
异常：
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