组蛋白是核内最丰富的蛋白质，它与DNA构成的复合物称为染色质。染色质最基本的亚单位结构是核小体(nucleosome)，它由146个碱基对组成的DNA链缠绕8个组蛋白分子(2个H2A-H2B杂二聚体之间夹着2个杂二聚体H2-H4)2圈构成的核心和核心外的组蛋白H1与连结DNA(约60个碱基对)组成。H1既与核心部分的DNA结合，也与连结DNA结合，后者起连结相邻核小体的作用。5种组蛋白都有各自对应的自身抗体。抗DNA的自身免疫反应与抗组蛋白的自身免疫反应间具有连锁性，抗DNA抗体阳性的患者常同时能检出抗组蛋白抗体，但抗组蛋白抗体阳性并不一定伴有抗DNA抗体。