PAP复合物的特点与该法试剂制备方法有关。首先用HRP去免疫动物，使其产生高效价、高特异性的抗HRP抗体，然后用HRP与之结合，因是离体制备的HRP抗HRP复合物，它的形成不同于其他抗原—抗体反应。在抗原稍过量时，所有的抗HRP抗体均参与形成可溶性PAP复合物，仅残留少许游离的HRP。而大多数抗原—抗体反应需要抗原绝对过量才能形成可溶性复合物。PAP复合物的形状相当稳定，不受抗原量的影响，无论最初加入的抗原、抗体过量与否，最终形成的PAP复合物其HRP/抗HRP之比绝大多数为3;2，应用离心沉降、液相扩散及电镜观察等方法，显示PAP复合物呈五角环状结构，3个角为HRP，另2个角为抗HRP抗体，分子质量为400～430kDa，此结构非常稳定。