男性内生殖器检查包括前列腺检查、精囊检查、睾丸检查等。睾丸过小(小于12毫升)或过软都表示睾丸发育不良，单侧过小对侧正常时还有可能生育，双侧都小的人精液中可能就会没有精子。阴囊内没有睾丸(隐睾症)也同样如此。附睾有无硬结常代表附睾有没有发生过炎症或结核，圆形的肿块很可能是精液囊肿可妨碍附睾管的畅通。附睾饱满而精液中没有精子可能是阻塞性无精子症。有无精索静脉曲张也是重要检查内容。