利用某些染料对组织进行染色，可以使病变显示更清楚。用于胃癌的诊断多采用亚甲蓝染色法。可以将微小病变、病变范围显示出，使活检取材更准确，也有助于手术切除。
不合宜人群：孕妇以及那些对色素剂有反应的人。
检查前禁忌：检查禁止饮食。
检查时要求：同者协调合作。
正常：
通过内镜活检孔注入20~40 ml新鲜制作的乙酸(0.6%)与靛胭脂(0.1%~0.4%)混合液至胃内。几分钟内黏膜表面显色增强，在蓝色背景下可观察到红色或黄色的早期胃癌区域。对23例EGC患者，白光胃镜、标准色素胃镜及AIM色素胃镜的诊断准确性分别为45%、87%与96%。AIM方法未出现并发症。
异常：
异常结果：正常胃肠道黏膜、肠化黏膜、不典型增生黏膜、早期肿瘤的腺体形态各有特征，肉眼无法区别。
导致该异常结果可能疾病为： 小肠肿瘤 咽喉部肿瘤 食管肿瘤
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