真菌组织病理学是深部真菌感染的重要诊断方法，组织中真菌的鉴定标志着病原学诊断水平。免疫组织化学根据真菌抗原性不同将真菌分类 。需要检查的人群是多引起角膜炎、泪小管炎等真菌感染症状的患者。
检查前禁忌：注意个人卫生，避免吃对皮肤有强烈刺激性的食物。
检查时要求：1、详询有无外伤史及手术史，受伤时间、场所，受伤后的处理，发病时间、病情发展经过，有无破伤风预防接种史;对女性患者，应详询分娩或流产史;如为新生儿，应询问分娩史及脐带处理的情况。有少数病例无损伤史，亦未见明显的创口。
2、检查受伤部位、创口情况，创口周围肌肉有无痉挛及抽动，特别注意腹直肌是否强直。如创口有渗出物或脱落的组织块，应行细菌学检查(包括涂片及厌氧菌培养)和病理检查。
3、观察患者有无牙关紧闭、阵发性抽搐、痉笑、角弓反张，全身强直及阵发性痉挛，特别注意呼吸道是否通畅，有无喉头痉挛。待患者安静后，再检查有无肺部并发症，也可行必要的辅助检查。
正常：
取怀疑有真菌感染的组织进行培养，用镜检等的检查方法，未检查出真菌则为正常状况。
异常：
异常结果：引起眼部感染的常见放线菌主要有链霉菌、奴卡氏菌等，多引起角膜炎、泪小管炎、泪囊炎、结膜炎等。新型隐球菌，可见于亚急性或慢性脑膜炎或肺部感染，也可侵犯皮肤、皮下组织、肌肉、淋巴结及肠道等处，由肺经血行播散时可侵犯所有脏器组织。不管发生哪类隐球菌感染，最后中枢神经系统终将受染。
导致该异常结果可能疾病为： 痣 CD30阳性皮肤T细胞淋巴瘤 背部弹力纤维瘤 多形性脂肪瘤
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