1、新生儿包涵体结膜炎，又称新生儿包涵体性脓漏眼。新生儿出生时，在患衣原体性宫颈炎的产道中受感染。50%～70%经有沙眼衣原体感染的母亲产道分娩的婴儿可感染沙眼衣原体，其中20%～50%可发生结膜炎。沙眼衣原体是近年来报道最常见的新生儿结膜炎的病原体，有报道高达74%。潜伏期5～12天。双眼发病，为急性或亚急性表现。眼睑红肿，睑结膜充血、肥厚、乳头肥大，主要见于下穹窿及下睑结膜。新生儿结膜的腺样层尚未发育，故2～3个月内无滤泡形成。可有假膜形成。角膜受累时表现为轻度上皮炎或近角膜周边部的上皮下小浸润，一般不发生角膜溃疡。分泌物多，初为浆液性，但很快发展成脓性。故应与新生儿淋菌性结膜炎鉴别，大约2～3周后转入慢性期。晚期有显著的滤泡形成，3个月至1年内自行消退，不留瘢痕，亦无角膜血管翳。

2、成人包涵体性结膜炎，又名游泳结膜炎，因为许多患者都有在污染的游泳池游泳史，实际上此病是由沙眼衣原体D-K型泌尿系统感染后污染的手、毛巾或水等传染到眼;有称是一种接触感染。妇科医生在检查衣原体性宫颈炎病人时，分泌物溅入眼内亦可得病。潜伏期5～12天。常单眼先发病，1～3周后波及另眼。开始时结膜充血，很快眼睑红肿，耳前淋巴结肿大，穹窿部结膜有很多滤泡，下方最著。结膜因细胞浸润而肥厚。结膜囊有很多脓性分泌物，内含大量多形核白细胞。结膜刮片可见包涵体。急性期消退后，结膜仍肥厚、充血、有滤泡，持续3个月至1年，不出现血管翳，不留瘢痕，而自然消退。

根据临床表现诊断不难。实验室检测手段同沙眼。新生儿包涵体性结膜炎上皮细胞的胞质内容易检出嗜碱性包涵体。血清学的检测对眼部感染的诊断无多大价值，但是检测IgM抗体水平对于诊断婴幼儿衣原体肺炎有很大帮助。新生儿包涵体性结膜炎需要和沙眼衣原体、淋球菌引起的感染鉴别。