与慢性鼻炎鉴别
慢性鼻炎流鼻涕不呈绿脓性，亦无臭味，故观察鼻涕的性质是鉴别关键；拍摄X光片检查鉴别可准确无误，慢性鼻炎病变局限于鼻腔，而慢性鼻窦炎则鼻窦内可见有炎性病变。
与神经性头痛鉴别
有些患神经性头痛的病人可长年头痛，反复发作，往往误认为有鼻窦炎，但这种病人基本没有鼻部症状，故从表现及拍X光片即可加以鉴别。
中医鼻窦炎的病理病因
鼻窦是头骨和面骨中围绕鼻腔周围的一些含气的空腔，包括上颔窦、额窦、筛窦和蝶窦。鼻窦炎是指化脓性球菌感染鼻窦粘膜引起的化脓性炎症，有急性和慢性之分。
急性鼻窦炎是鼻腔粘膜的急性化脓性炎症，可一个鼻窦单独发病，也可几个鼻窦同时发炎，如果急性鼻窦炎治疗不当，或反复发作，可致慢性鼻窦炎。
本病绝大多数由伤风感冒引起，全身抵抗力低下，其它鼻腔疾病常有鼻涕阻塞，游泳、跳水方法不当，以及气压的迅速改变（如飞行、潜水等）均可导致本病的发生。
由牙根感染扩散引起的上颌窦炎叫牙原性上颌窦炎，也是鼻窦炎的一种。