子宫性闭经：由于子宫内膜对激素不起反应或反应低下而引起。多见于子宫内膜结核、子宫内膜损伤(如刮宫后子宫内股不再生)、子宫内膜粘连及发育不良等。这种病人即使通过人工的激素调节(人工周期)，子宫内膜也不会脱落出血。

卵巢性闭经：主要由卵巢疾病所引起。由于雌激素水平过低，不能促使子宫内膜生长，如先天性卵巢发育不良、卵巢早衰、无反应卵巢等。这些人体内雌激素水平低而促性腺激素却正常或偏高，可应用人工周期治疗。

垂体性闭经：闭经与垂体功能不足有关，可见于颅脑损伤、席汉氏综合征、颅脑部放射治疗后等。

下丘脑性闭经：问题出在下丘脑，可以是神经系统器质性疾病，如炎症、肿瘤、缺血等造成的，也可以是精神因素、环境改变、全身疾病、营养不良及药物影响造成的。