1.胆总管下段结石 需与乳头括约肌痉挛和牵涉到胆总管的器质性病变进行鉴别。可通过十二指肠镜逆行胰胆管造影(ERCP)及经皮经肝胆管造影(PTC)检查进行鉴别。

2.胆囊(管)结石 可导致胆囊扩张，需与高张性胆囊和低动性胆囊进行鉴别。影像学诊断(B超、CT及MRI)可发现胆囊(管)结石，从而确诊。

3.乏特壶腹周围炎症及感染 其表现可与Oddi括约肌张力增高类似，但多可经内镜检查加以确诊。

4.壶腹周围及胰头肿瘤 可通过B超、内镜检查、PTC等影像学检查及手术探查与Oddi括约肌张力增高区分开来。

5.慢性胰腺炎 其临床表现可类似于胆道运动功能障碍，但前者粪便中可有大量脂肪滴和未消化的肌纤维，多项影像学检查可发现胰管及胰腺外形的改变。

6.不典型心绞痛和心肌梗死 其临床表现可类似于胆道运动功能障碍，但心电图和(或)心肌酶谱检查可发现心脏病的相应改变。