1、胆囊(管)结石 ：可导致胆囊扩张，需与胆囊收缩功能不良进行鉴别。影像学诊断(B超、CT及MRI)可发现胆囊(管)结石，从而确诊。
2、慢性胰腺炎 ：其临床表现可类似于胆囊收缩功能不良，但前者粪便中可有大量脂肪滴和未消化的肌纤维，多项影像学检查可发现胰管及胰腺外形的改变。
3、不典型心绞痛和心肌梗死 其临床表现可类似于胆囊收缩功能不良，但心电图和(或)心肌酶谱检查可发现心脏病的相应改变。