低血糖综合征的鉴别诊断比较多，鉴别时应注意：①年老体衰、轻症患者、有动脉硬化症患者的个体差异;②伴发腺垂体功能低下，肾上腺皮质功能低下与甲状腺功能低下者;③糖尿病产妇;④重型肝炎、肾炎;⑤并用潜在性降血糖药物，如保泰松、磺胺异恶唑、氯霉素及双香豆素等，可加强D860作用，兴奋胰岛素的分泌而降血糖。

按Whipple三联征诊断低血糖的准确率可达91%，再加病史，血糖及血清胰岛素的测定等可提高诊断水平。一般临床上比较少用D860、左旋亮氨酸及胰高糖素试验。可选择性地做各种检查，常用OGTT 胰岛素释放试验及禁食试验。正常人胰腺β细胞在不同因素的刺激下释放胰岛素数量不一，由多至少的顺序为葡萄糖耐量试验>D860试验>胰高糖素试验>亮氨酸试验，而胰岛素瘤者的顺序为胰高糖素试验>D860试验>亮氨酸试验>葡萄糖耐量试验，对葡萄糖的敏感性较低。应与癫痫、晕厥、脑瘤、糖尿病酮症酸中毒昏迷、甲旁减、脑血管意外、尿毒症、癔症、肝原性昏迷等症作鉴别诊断。常见三种低血糖综合征的鉴别。