肺鼠疫须与其他肺部炎症鉴别，如大叶性肺炎，肺炭疽，钩端螺旋体病肺出血型及支原体肺炎。取患者的病灶性渗出物、痰液、分泌物、血及脑脊液等作涂片或培养，可发现病原菌。可作荚膜染色，特异性荧光抗体染色以进一步鉴定，上述检材可培养或接种于豚鼠等动物的皮下组织分离炭疽杆菌。

       酶联免疫吸附测定传统阿斯可里沉淀试验敏感性和特异性都不高。间接免疫荧光法荧光抗体检测有较高的敏感性、特异性。