放射性肠炎引致的并发症主要有肠狭窄和肠梗阻，慢性放射性肠粘连，肠狭窄常发生不全性、甚至完全性肠梗阻。大剂量照射所致小肠或结、直肠可出现溃疡甚至穿孔，从而导致直肠阴道瘘、直肠膀胱瘘或回乙结肠瘘，胃肠道溃疡和穿孔。已有大量的数据表明人接受放射线可以致癌，实际上可将其描述为一把“双刃剑”，因其既是恶性肿瘤的主要治疗手段，同时又可以诱发恶性肿瘤。因此放射性肠炎可并发或诱发结、直肠癌等。