组织病理学检查，肛管癌多为鳞状细胞癌，少数为腺癌或恶性黑色素瘤。

1.肛门指诊：齿线附近可触及肿块，指套染有腥臭分泌物。

2.肛窥器检查：可见肛管内肿块呈息肉样、蕈状或有溃疡和浸润，肛管缩窄。临床上多见，一般以肛旁脓肿开始，局部疼痛明显，脓肿破溃后形成瘘，疼痛亦随之减轻。肛瘘多数在肛管后正中处，并与齿状线相连，肛管黏膜完整。有时形成硬结或条索状。指检时挤压可见瘘口流出脓性分泌物，往往在坐浴和抗感染后症状好转。肛瘘用探针检查即可证实，如疑有癌变，则应活检明确诊断。