巨细胞修复性肉芽肿常见10岁～20岁青少年，好发下颌骨。现在认为发生于颌骨者通常并非真性GCT而是巨细胞修复性肉芽肿。镜下多核巨细胞体积小，中等数量，分布不均匀，常聚集于出血、坏死与含铁血黄素沉积部位，并可见骨样与骨组织形成，病灶经单纯刮除后预后较好。

动脉瘤样骨囊肿多发生于20岁以下的青少年。好发椎骨及扁骨，但也可发生于长骨干。X线上与GCT相似，呈骨的偏心膨胀，骨皮质消融，与GCT镜下不同的是多核巨细胞分布不均且多位于血管囊肿和出血灶附近，胞体较小，间质为成熟的纤维组织。单纯病灶刮除四分之一会复发，大块切除或刮除并结合骨移植效果较好。多核巨细胞性骨病变十分复杂，稍不警惕就易造成误诊，对于患者是儿童，病变在除骶骨外的椎骨、颌骨和手足骨，病灶多发，通常不是GCT。特别值得一提的是骨折时可因坏死、出血及多核巨细胞反应而误诊为GCT合并病理性骨折，应加以鉴别。

孤立性骨囊肿 多发于青少年骨骺未愈合以前的干骺端，呈对称性膨胀，分隔较少。

成软骨细胞瘤 好发于20岁以下者的长骨骨骺部，瘤内常有钙化点，房隔较少，边缘较清晰。

非骨化性纤维瘤 多见于青少年，好发于长管状骨骨干上，偏心性生长，多沿长轴发展，边缘清晰，有硬化边。