1.化脓性汗腺炎 多在肛门周围与臀部皮下，脓肿浅广而病变范围广泛，皮肤增厚变硬，急性小脓肿与慢性窦道并存，穿肛窜臀，脓液粘稠呈白粉粥样，并有臭味。慢性病容，有消耗症状，如消瘦、虚弱等。

2.肛周毛囊炎和疖肿 好发于尾骨及肛周皮下，肿胀略突出，有溢脓外口，外口有脓栓，肛内指诊，无内口。

3.骶骨前畸胎瘤溃后感染 有时与直肠后部脓肿相似。肛内指诊直肠后肿块光滑，无明显压痛，有囊性感。多为先天性，应追问病史。X线检查可见骶前肿物将直肠推向前方，可有散在钙化阴影。病理检查可确诊。

4，克隆氏病并发肛周脓肿 约占结肠克隆氏病的20%。局部红肿，多自溃，常伴有不典型的肛门皲裂和瘘道无明显疼痛。结合病史、全身症状和纤维结肠镜检查、病理检查，不难鉴别。

5.肛周子宫内膜异位症 女性肛周表浅性隆起、漫肿。肿痛多与月经周期一致，常继发感染化脓。追问病史，结合症状，常可鉴别，病理检查可确诊。

6.阴茎海绵体炎 会阴部红、肿、热、痛，海绵体肿大变硬，压痛非常敏感，有时误认为会阴部脓肿。另外，肛门前部脓肿或肛瘘感染化脓时，也可波及到会阴部和阴茎海绵体周围，应详细检查鉴别，必要时请泌尿科会诊。

7.肛门直肠肿瘤 良性肿瘤多局限，可移动，局部症状较轻，一般不溃破。恶性肿瘤坚硬固定，表面溃烂，凸凹不整，表面常有脓血分泌物，恶臭污秽。