体格检查可排除其他引起直肠疼痛的疾病(如痔,肛裂,脓肿)。体格检查往往正常,如果直肠的查体可以扪及到柔软样的包块者，需要与痔疮相鉴别，如果有剧烈的疼痛者常提示是肛裂。尽管可有肛提肌的触痛或僵硬感,常位于左侧,少数患者可由后下位或前列腺疾病所引起，应注意区别。
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