有时需与结核性、新型隐球菌性脑膜炎、疱疹性脑膜脑炎相鉴别，通过病原学检查，血清和脑脊液抗弓形体抗体检查呈阳性，不难鉴别。化脓性脑膜炎，流行性脑膜炎蛋白质含量为3-6.5g/L;结核性脑膜炎刺激症状期蛋白质含量为0.3-2.0g/L，压迫症状期为1.9-7g/L，麻痹期为0.5-6.5g/L;脑炎蛋白质含量为0.5-3.0g/L。注意与本病鉴别诊断。