本病需与细菌性呼吸道疾病如链球菌咽峡炎、化脓性鼻窦炎和细菌性肺炎等相鉴别。

       一般细菌性感染起病急，发热热度较高，分泌物常呈脓性，白细胞总数增多，中性粒细胞明显升高，抗菌药物治疗效果好。

       主要根据临床表现、白细胞计数和分类、X线检查及有关的流行病学资料加以鉴别。确定诊断有赖于病毒分离、抗原抗体及病毒核酸的检测。因为同一临床综合征可由多种病毒或同一病毒的多个血清型引起；而且多数上呼吸道病毒感染为自限性；现有的病原诊断方法的敏感性、特异性有限，或费时较长或需要特殊设备条件，使其临床实用性受限。上述的病原诊断方法主要用于流行病学调查和研究。