1.各种机会感染和肿瘤发生 如卡氏肺囊虫肺炎，发生率50%～60%。表现为咳嗽、咳痰、气促，肺部体征不多，胸部X线检查多呈双侧间质性炎症或肺门周围炎;是导致艾滋病患者死亡的重要原因。念珠菌病，多由白色念珠菌引起，常表现为口咽炎、食管炎及胃肠炎等。还可发生人疱疹病毒感染、脑弓形虫病等。肿瘤中以Kaposi肉瘤或非霍奇金淋巴瘤最为常见。

2.胃肠道感染 如食管炎或食管溃疡可引起吞咽痛和胸骨后不适感，食管溃疡还可同时并发出血。结肠炎者可引起水样腹泻，若同时合并溃疡，则有发生肠穿孔的危险。