本病除颅内感染直接播散外，主要为眼眶、面部、口腔、咽喉、耳、鼻、及副鼻窦等处的化脓性病灶蔓延而来。亦可由全身传染病的迁徒性感染所致，此外与体质虚弱、心功能不全及外伤等有关。

引起海绵窦血栓的原因可以分为感染性和非感染性。

感染性：顾名思义，是由发生在头皮、颜面、鼻窦、眼、咽、耳等部位的感染，经静脉回流蔓延至海绵窦而引起的。

非感染性：可能是因为头面部外伤、身体其他部位肿瘤或结核转移而发病的。