结核性葡萄膜炎的诊断总体来说比较困难，有关结核性葡萄膜炎目前尚无满意的诊断标准，但在诊断时应满足以下条件：
①能够排除其他原因所致的葡萄膜炎;
②符合结核性葡萄膜炎的临床特点;
③眼内液分离培养出结核分枝杆菌;
④抗结核治疗可使眼部病变减轻;
⑤存在眼外结核病变或有眼外结核病史;
⑥结核菌素皮肤试验阳性;
⑦眼内液标本经PCR检测出结核分枝杆菌的核酸;
⑧眼内活检标本中发现抗酸杆菌，其中第①，②条为必备条件，③，④，⑤，⑥，⑦条中，如具有第③条或其他任意2条即可做出诊断。
与其他类似疾病的鉴别主要在于病原体的确定。