患沙眼后有眼红、粘性物、眼痒、眼痛等不适，眼睑结膜面有滤泡、红肿、炎症性增厚使血管模糊、经过反复感染眼睑的结膜面出现白色条纹疤痕，上睑下垂：当疤痕引起眼睑内层增厚和眼睑形态改变，眼睑肌失去收缩能力引起眼睑下垂。
睑内翻倒睫：结膜瘢痕收缩和睑板弯曲畸形，使睑缘向内翻转，牵拉睫毛倒向角膜侧生长，睫毛摩擦角膜。
角膜混浊：倒睫持续摩擦角膜，刺激角膜出现新生血管，像垂帘状长入角膜，称之为沙眼角膜血管翳，严重的角膜血管翳及睑内翻倒睫摩擦角膜以致角膜溃疡，角膜混浊变白，视力下降。
睑球粘连：睑结膜与球结膜连接部为穹窿部，可因结膜瘢痕收缩而缩短，甚至完全消失，牵引下睑时在眼睑和眼球间的结膜可见有垂直的皱襞，使睑结膜与球结膜粘连。
结膜干燥症：由于结膜广泛结瘢，使杯细胞和泪腺分泌功能遭到破坏，泪腺管闭塞，导致结膜不能被湿润，而逐渐干燥，角结膜上皮发生角化，表现为干涩、刺痒等不适。
慢性泪囊炎：沙眼病变累及泪道粘膜，鼻泪管发生狭窄或阻塞，导致慢性泪囊炎，表现为流泪、流脓或挤压鼻根部大量脓液溢出。