人感染猪流感潜伏期一般1至7天左右，较流感、禽流感潜伏期长。
(一)临床症状
人感染猪流感后的早期症状与普通人流感相似，包括发热、咳嗽、喉痛、身体疼痛、头痛、发冷和疲劳等，有些还会出现腹泻或呕吐、肌肉痛或疲倦、眼睛发红等。
部分患者病情可迅速进展，来势凶猛、突然高热、体温超过39℃，甚至继发严重肺炎、急性呼吸窘迫综合征、肺出血、胸腔积液、全血细胞减少、肾功能衰竭、败血症、休克及Reye综合征、呼吸衰竭及多器官损伤，导致死亡。
(二)体征
肺部体征常不明显，部分患者可闻及湿罗音或有肺部实变体征等。
(三)预后
人感染猪流感的预后与感染的病毒亚型有关，大多预后良好;综合各国已统计的甲型H1N1流感确诊病例，在每100名甲流患者中，有大约1到10名重症患者需要住院治疗，在每100名住院的重症患者中，有10到25人被送到重症监护病房，其中有2到9人死亡。因此，由于医疗条件等差异，甲型H1N1流感患者的总体死亡率介于万分之二到千分之九之间
(四)人感染猪流感的诊断标准
1.医学观察病例：曾到过猪流感疫区，或与病猪及猪流感患者有密切接触史，1周内出现流感临床表现者。列为医学观察病例者，对其进行7天医学观察(根据病情可以居家或医院隔离)。
2.疑似病例：曾到过疫区，或与病猪及猪流感患者有密切接触史(也可流行病学史不详)，1周内出现流感临床表现，呼吸道分泌物、咽试子、痰液、血清H亚型病毒抗体阳性或核酸检测阳性。
3.临床诊断病例：被诊断为疑似病例，且与其有共同暴露史的人被诊断为确诊病例者。
4.确诊病例：从呼吸道标本或血清中分离到特定病毒;RT-PCR对上述标本检测，有猪流感病毒RNA存在，经过测序证实，或两次血清抗体滴度4倍升高，可确诊为人感染猪流感。
