主要考虑其他原因所致的淋巴细胞性(无菌性、病毒性)脑膜炎，如流行性腮腺炎病毒、风疹病毒、肠道病毒及其他病毒引起的脑膜炎。有时亦应与结核性脑膜炎相鉴别。
有时亦应与结核性脑膜炎相鉴别。淋巴细胞性脉络丛脑膜炎的典型症状:背痛、腹泻、昏迷、肌肉酸痛、咳嗽、淋巴结肿大、脑膜刺激征、脑膜炎相鉴别。
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