梅毒性葡萄膜炎可表现为肉芽肿性炎症，也可表现为非肉芽肿性炎症;可发生于眼前段，也可发生于眼后段。根据解剖位置分类，可表现为前、后、中间和全葡萄膜炎，在临床表现上也少有特征性改变，所以应与各种原因所致的葡萄膜炎和多种特定类型的葡萄膜炎相鉴别，表2列出了应与此病鉴别的几种主要葡萄膜炎。

与HLA-B27抗原相关的前葡萄膜炎鉴别点是后者可以反复发作，HLA-B27抗原阳性，骶髂关节和脊椎拍片显示强直性脊椎炎等，或出现牛皮癣、炎症性肠道疾病，患者预后较好。