顶枕部脑膜脑膨出主要与头皮良性肿块和颅周窦鉴别。头皮良性肿块通常不在中线，哭闹时肿块无改变，X线平片或CT可见肿块位于颅骨外，颅骨无缺损。颅周窦或血管瘤与颅内静脉窦交通，随头部位置的改变肿块大小变化明显，穿刺可抽到血 液，注入造影剂 可能使颅内静脉窦显影。

颅底脑膜脑膨出应与鼻息肉和鼻咽部肿瘤鉴别，尤其是儿童患者在行鼻咽部穿刺活检前，应考虑到脑膜脑膨出存在的可能性，以避免发生脑脊液漏及并发颅内感染。