本病需与广州管圆线虫病、猪囊尾蚴病、曼氏裂头蚴病、斯氏狸殖吸虫蚴病、犬弓首线虫蚴病作鉴别诊断。从感染病史来看颚口线虫病患者常有生吃鱼类、肉类史，而广州管圆线虫病发病前有进食未煮熟的淡水螺史，猪囊尾蚴病发病前患者有进食生蔬菜史，曼氏裂头蚴病发病前患者有进食未煮熟的淡水虾、蟹、鱼肉史，斯氏狸殖吸虫蚴病发病前患者有进食未煮熟的淡水虾、蟹、鱼肉史，犬弓首线虫蚴病发病前患者常有与狗密切接触史。从临床表现上广州管圆线虫病多无皮下游走性肿块;斯氏狸殖吸虫蚴病、犬弓首线虫蚴病少有皮下游走性肿块。最有效的鉴别办法是通过对病变部位的活组织检查检出病原虫进行形态学比较做出鉴别。