食管克罗恩病合并有食管梗阻、穿孔、瘘管形成、癌变、大出血等严重并发症。
1.食道内被食物团块或异物所阻塞,致使食道阻塞而引起的一种疾病。食管梗塞又称食管梗阻，是指食管被草料、异物所堵塞的疾病。以突然咽下障碍为特征。各种动物均可发生，最常见于牛和羊。按照程度，可分为完全阻塞和不完全阻塞。
2.食管穿孔的症状:
(1)颈段食管穿孔：病人颈活动时疼痛，颈痛且常伴有胸锁乳突肌的压痛，痉挛，尚可有发音困难，吞咽困难和声音嘶哑，体检时60%的病人有颈皮下气肿，而X线检查可使95%的病人得以确诊。
(2)胸段食管穿孔：病人感觉胸前区，肩胛间区及剑突下疼痛，吞咽及深呼吸时疼痛可加重，后纵隔广泛炎症所引起的背痛的特点与胸主动脉夹层动脉瘤的疼痛非常相似，胸部食管穿孔常有上腹部的肌紧张，吞咽困难，吞咽时疼痛，呼吸困难，呕血，发绀，胸部听诊可闻及纵隔气肿的捻发音即Hamman征，随着炎症的进展还可出现心动过速，呼吸急促及发热，如不及时治疗，进一步可出现败血症及休克。
(3)腹段食管穿孔：主要表现为剑突下疼痛，肌紧张，痉挛及反跳痛，一旦出现心动过速，呼吸急促及发热等症状，便可迅速发展为败血症及休克是腹部食管穿孔的特点。