梭形细胞脂肪瘤和多形性脂肪瘤有相似的细胞遗传学改变。核型较普通脂肪瘤复杂，常见亚二倍体，经常有多位点缺失，没有获得多余序列的情况，很少有平衡易位。有报道在10例病人中发现有7~8例有13或16号染色体单体或部分缺失。累及16号染色体的肿瘤一半有16q13断裂点，所有病例都有16q13-
qter缺失。13号染色体最常见的缺失区带是13q12和13q14-q22.其他2~3例缺失的染色体区带是6pter-p23、6q15-q21、10pter-p15、10q23-qter和17qter-p13[442].
