生理学的研究，已证实血浆白蛋白和球蛋白的分解产物中，仅10%左右从肠道排出。因此，认为正常人生理情况下胃肠道蛋白质的丢失可以忽略不计。
蛋白质丢失性胃肠病的发病机制主要有三：
1.胃肠黏膜糜烂或溃疡导致蛋白渗出或漏出
2.黏膜细胞损伤或缺失细胞间紧密连接增宽导致黏膜通透性增加血浆蛋白漏入肠腔
3.肠淋巴管阻塞，肠间质压力升高使富含蛋白质的肠间质，不但不能保持在间质中或被吸收入血循环，反而使其溢出进入肠腔，而丢失肠道炎症。引起蛋白丢失性胃肠病的机制还不清楚，可能是由于炎症区细胞外液和炎性液体渗出所致。