主要与各种类型的胃病和胃血管疾病相鉴别。

1.门静脉高压性胃病(PHG) PHG的病变多发于胃底，胃镜下黏膜有特异的马赛克征、猩红热样疹及樱桃红斑点，在组织学上差异更大。治疗上，PHG的治疗是以药物及其他降门静脉压的措施为主。而GAVE应用内镜下激光凝固治疗效果好。

2.其他 必须排除诸如幽门螺杆菌(Hp)相关性胃炎、酒精性胃炎、胃黏膜糜烂、药物相关性胃炎、胆汁性胃炎、胃血管发育不良等，上述情况既无GAVE所特有西瓜皮样内镜特点又无其特有的组织病理学诊断依据，容易鉴别。