主要应与单纯性甲状腺肿和Grave病的鉴别。

对慢性淋巴性甲状腺炎伴有暂时甲亢症状与Grave病鉴别在儿科临床是非常困难的，如有突眼出现应考虑Grave病。最好的鉴别诊断试验是：吸131I摄取试验，若吸碘后6h，24h吸碘率低或正常应考虑CLT;若6h和24h吸碘率增高考虑为Grave病。T3抑制试验，Grave病不被抑制。血清中存在甲状腺刺激免疫球蛋白是Grave病特点，为诊断本病较可靠证据。

甲状腺穿刺活检对鉴别单纯性甲状腺肿、甲状腺肿瘤等有一定价值。