1.行军性血红蛋白尿症与阵发性寒冷性血红蛋白尿症的鉴别 较容易。阵发性睡眠性血红蛋白尿症可因运动而加剧，注意与本症的鉴别。

2.运动后也可发生肌红蛋白尿 患者常有强力的肌痛及压痛。肌红蛋白分子量小，易从肾脏排出，发作时血浆结合珠蛋白浓度不降低。小心抽取血浆，肌红蛋白尿时血浆外观正常而血红蛋白尿的血浆为红棕色。此外，由于两者的分子量不同，各自的电泳速度也不同，且肌红蛋白能溶于80%的硫酸铵饱和溶液，而血红蛋白则不能。可依据这些不同的理化特性来鉴别。