(一)发病原因

本病主要由感染引起，以病毒感染为多，其中最重要的是柯萨奇B病毒，占病原体的一半以上。目前已分离到B3、B4、B5等型。ECHO、巨细胞病毒、风疹、水痘和腺病毒亦可致该病。新生儿室内的流行，常由柯萨奇、ECHO病毒所致，而巨细胞病毒、风疹、水痘病毒多见于母妊娠期引起胎儿宫内感染，往往在新生儿早期即可发病。此外，细菌、螺旋体、立克次体、真菌、原虫等也可为该病之病原。引起心肌炎的病毒感染可发生在宫内、产时或生后，孕妇宫内感染时，病毒可通过胎盘传播给胎儿。本病可在婴儿室、母婴同室及产科发生暴发流行，病情严重，病死率高。

(二)发病机制

新生儿心肌炎的病理变化可轻重不等。心脏扩大，外观苍白。电镜下可见心肌炎、心包炎，心瓣膜多正常。心肌由淋巴细胞、大单核细胞、嗜酸性和中性粒细胞浸润，多密集呈斑点状。后期常有心肌纤维局限性退行性变及坏死。除心肌损害外，脑、肝细胞也常可累及。